有力的证据表明SARS-CoV-2可能会将其插入人类基因组

我们的基因组是一个堆满了曾经困扰我们祖先的病毒遗传片段的墓地。 如果麻省理工学院的研究人员有争议的说法能够抵制对此提出的批评，那么当前大流行背后的病毒很有可能会加入他们的行列。

在我们的基因中散布着几段病毒代码并不一定意味着大流行将继续存在。 它甚至可以在某种程度上解释为什么少数患者在康复后很长时间仍会继续检测COVID-19优势。

但是SARS-CoV-2根本不具备将自己掩埋在我们的基因库中的工具，这意味着它将需要一种说服我们自己的机构代表其管理工作的工具。

麻省理工学院怀特黑德研究所的生物医学研究员张力国说：“ SARS-CoV-2不是逆转录病毒，这意味着它不需要反转录即可复制。”

“但是，已经在包括人类在内的许多脊椎动物物种的基因组中检测到了非逆转录病毒RNA病毒序列。”

去年，张和他的团队分享了一项调查的初步结果，表明SARS-CoV-2毕竟可能有一种方法可以完成这一任务。

利用已公布的感染细胞培养物和患者样品的数据集，研究小组在细胞产生的序列中鉴定了部分人类，部分病毒的转录本。

随后进行的实验评估了SARS-CoV-2颗粒的存在是否足以刺激细胞产生某些酶，这些酶专门用于将RNA反转录为DNA。

他们的发现支持了冠状病毒序列可以复制并粘贴到我们基因组中的可能性。 重要的是，并非科学界的每个人都对证据深信不疑。

部分由于该研究在进入同行评审过程之前已作为预印本公开提供，其他研究人员对此表示强烈怀疑，他们还指出，病毒-人序列可能只是用于该方法的人工产物。找到他们。

一些人表示担心，这可能会更难缓解人们对基于病毒代码的疫苗会改变我们的DNA的担忧，这一论点可能不会反驳结果，但确实强调了在公开之前确定您的发现的价值。

正如研究人员自己承认的那样，这些批评是公正的。 因此，团队开始寻找更可靠的数据来构建案例。

他们的工作现已通过同行评审，并发表在PNAS中。 在最新的研究中，研究人员提供了新的理由，认为在感染消失很久之后，对我们全球社区造成严重破坏的冠状病毒可能会困扰我们的细胞。

除了寻找冠状病毒-人类基因片段的嵌合体，并寻找病毒指挥转录工具的迹象外，研究小组还直接搜索了人类基因组中实际病毒序列的证据。

他们甚至使用三种不同的DNA测序技术来确保其结果不是任何一种技术的产物。

在每种情况下，他们都发现SARS-CoV-2遗传物质的片段滑入了故意感染细胞的遗传库中，例如从违禁品书中撕下的页面。

一半的“页面”是随机上下颠倒插入的事实增加了这样的论点，即它们不是被活病毒故意插入的。

经过进一步检查，这些流氓元素两侧的序列也不是随机的文本。 该编码带有一种称为转座子的东西的签名-所谓的跳跃基因，其进化出一种脱落的方法，并将其自身插入其他地方的基因组中。

一些转座子通过使用从过去的病毒感染中偷来的酶来解决这一问题。 曾经被病毒用来将自身编辑为主机的被劫持的硬件，但现在只能用作转座序列本身而不能用作主机。

一种这样的序列称为LINE1逆转座子，占我们整个基因组的17％，令人难以置信。 尽管大多数人失去了打包和移动的才能，但有些人足够活跃，仍然偶尔会引起恶作剧。

它可能使SARS-CoV-2能够公开访问我们的DNA。

怀特海德研究所生物学家鲁道夫·贾尼施（Rudolf Jaenisch）说：“ LINE1集成的足迹非常明显。”

“在病毒序列与细胞DNA的连接处，它进行了20个碱基对的复制。”

但是，这项工作是在实验室感染的细胞培养物中完成的，并且并非真正的人类宿主仍然令人怀疑。 还有一个问题是什么意思-尽管这些片段无法构建新的感染性颗粒，但尚不清楚它们是否可能以其他方式具有生物活性，无论是好是坏。

贾尼施说：“在这一点上，我们只能推测。”

由于人们对这一毁灭性大流行病给予了极大关注，因此我们可以相信，不久就将有各种猜测成为解决方案，以确保这种冠状病毒成为我们鼠疫墓地中的又一个幽灵。

这项研究发表在PNAS上。